MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli ETEC H10407

Total Repeats: 91141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017633	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387610478
2	NC_017633	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387610478
3	NC_017633	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387610479
4	NC_017633	CAGG	2	8	420	427	25 %	0 %	50 %	25 %	387610479
5	NC_017633	CT	3	6	445	450	0 %	50 %	0 %	50 %	387610479
6	NC_017633	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	387610479
7	NC_017633	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387610479
8	NC_017633	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610479
9	NC_017633	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	387610479
10	NC_017633	CGC	3	9	570	578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387610479
11	NC_017633	TCG	2	6	614	619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610479
12	NC_017633	CGCTG	2	10	693	702	0 %	20 %	40 %	40 %	387610479
13	NC_017633	ACT	2	6	795	800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610479
14	NC_017633	CCG	2	6	849	854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387610479
15	NC_017633	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387610479
16	NC_017633	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387610479
17	NC_017633	ACT	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610479
18	NC_017633	CGG	2	6	968	973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387610479
19	NC_017633	GCTG	2	8	975	982	0 %	25 %	50 %	25 %	387610479
20	NC_017633	TTG	2	6	999	1004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387610479
21	NC_017633	GGAC	2	8	1013	1020	25 %	0 %	50 %	25 %	387610479
22	NC_017633	GTT	2	6	1068	1073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387610479
23	NC_017633	TTC	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387610479
24	NC_017633	TGA	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610479
25	NC_017633	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387610479
26	NC_017633	GC	3	6	1333	1338	0 %	0 %	50 %	50 %	387610479
27	NC_017633	GTG	2	6	1372	1377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387610479
28	NC_017633	ATC	2	6	1389	1394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610479
29	NC_017633	TG	3	6	1435	1440	0 %	50 %	50 %	0 %	387610479
30	NC_017633	AAG	2	6	1484	1489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387610479
31	NC_017633	GGT	2	6	1536	1541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387610479
32	NC_017633	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387610479
33	NC_017633	GAT	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610479
34	NC_017633	TCA	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610479
35	NC_017633	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610479
36	NC_017633	CAA	2	6	1795	1800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387610479
37	NC_017633	GCTG	2	8	1802	1809	0 %	25 %	50 %	25 %	387610479
38	NC_017633	GAA	2	6	1903	1908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387610479
39	NC_017633	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610479
40	NC_017633	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387610479
41	NC_017633	CCAG	2	8	2003	2010	25 %	0 %	25 %	50 %	387610479
42	NC_017633	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610479
43	NC_017633	TAC	2	6	2098	2103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610479
44	NC_017633	GCG	2	6	2119	2124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387610479
45	NC_017633	CGG	2	6	2134	2139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387610479
46	NC_017633	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610479
47	NC_017633	TGA	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610479
48	NC_017633	GAT	2	6	2350	2355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610479
49	NC_017633	ATTGAA	2	12	2431	2442	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387610479
50	NC_017633	TGC	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610479
51	NC_017633	CGA	2	6	2511	2516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387610479
52	NC_017633	CG	4	8	2526	2533	0 %	0 %	50 %	50 %	387610479
53	NC_017633	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610479
54	NC_017633	TGA	2	6	2583	2588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610479
55	NC_017633	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387610479
56	NC_017633	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610479
57	NC_017633	GCT	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610479
58	NC_017633	CTG	2	6	2764	2769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610479
59	NC_017633	GCG	2	6	2864	2869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387610480
60	NC_017633	GGC	2	6	2917	2922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387610480
61	NC_017633	CAA	2	6	2938	2943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387610480
62	NC_017633	GCAA	2	8	3030	3037	50 %	0 %	25 %	25 %	387610480
63	NC_017633	GGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387610480
64	NC_017633	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	387610480
65	NC_017633	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387610480
66	NC_017633	GGT	2	6	3245	3250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387610480
67	NC_017633	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610480
68	NC_017633	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387610480
69	NC_017633	CAT	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610480
70	NC_017633	CAGC	2	8	3283	3290	25 %	0 %	25 %	50 %	387610480
71	NC_017633	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610480
72	NC_017633	CGC	2	6	3386	3391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387610480
73	NC_017633	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	387610480
74	NC_017633	TTCA	2	8	3428	3435	25 %	50 %	0 %	25 %	387610480
75	NC_017633	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610480
76	NC_017633	AGCG	2	8	3565	3572	25 %	0 %	50 %	25 %	387610480
77	NC_017633	TCCGGC	2	12	3578	3589	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387610480
78	NC_017633	TG	3	6	3606	3611	0 %	50 %	50 %	0 %	387610480
79	NC_017633	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387610480
80	NC_017633	T	6	6	3821	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	387610481
81	NC_017633	CTGA	2	8	3851	3858	25 %	25 %	25 %	25 %	387610481
82	NC_017633	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610481
83	NC_017633	TGA	2	6	3925	3930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610481
84	NC_017633	GC	3	6	3961	3966	0 %	0 %	50 %	50 %	387610481
85	NC_017633	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387610481
86	NC_017633	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387610481
87	NC_017633	TGA	3	9	4324	4332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610481
88	NC_017633	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610481
89	NC_017633	AGG	2	6	4437	4442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387610481
90	NC_017633	GTT	2	6	4457	4462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387610481
91	NC_017633	CGG	2	6	4494	4499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387610481
92	NC_017633	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610481
93	NC_017633	TGC	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610481
94	NC_017633	ACG	2	6	4584	4589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387610481
95	NC_017633	AAC	2	6	4652	4657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387610481
96	NC_017633	GTT	2	6	4675	4680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387610481
97	NC_017633	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387610481
98	NC_017633	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610481
99	NC_017633	AG	3	6	4882	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	387610481
100	NC_017633	CCG	2	6	4974	4979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387610481
101	NC_017633	TGC	2	6	4984	4989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610481
102	NC_017633	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610481
103	NC_017633	ATC	2	6	5010	5015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610481
104	NC_017633	TTA	2	6	5362	5367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387610482
105	NC_017633	TGG	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387610482
106	NC_017633	ACA	2	6	5407	5412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387610482
107	NC_017633	CCG	2	6	5450	5455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387610482
108	NC_017633	CCG	2	6	5459	5464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387610482
109	NC_017633	TCA	2	6	5482	5487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610482
110	NC_017633	ATC	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610482
111	NC_017633	CGG	2	6	5497	5502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387610482
112	NC_017633	GCT	2	6	5688	5693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610483
113	NC_017633	GGA	2	6	5725	5730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387610483
114	NC_017633	TCA	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610483
115	NC_017633	AAG	2	6	5741	5746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387610483
116	NC_017633	CAGT	2	8	5766	5773	25 %	25 %	25 %	25 %	387610483
117	NC_017633	AAT	2	6	5800	5805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387610483
118	NC_017633	TCA	2	6	5814	5819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610483
119	NC_017633	TTC	2	6	5867	5872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387610483
120	NC_017633	TTC	2	6	5912	5917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387610483
121	NC_017633	CAC	2	6	5959	5964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387610483
122	NC_017633	TGC	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610483
123	NC_017633	TTG	2	6	5999	6004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387610483
124	NC_017633	TGA	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610483
125	NC_017633	AAATCG	2	12	6152	6163	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387610483
126	NC_017633	AGCG	2	8	6270	6277	25 %	0 %	50 %	25 %	387610483
127	NC_017633	CTG	2	6	6361	6366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610483
128	NC_017633	GTG	2	6	6401	6406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387610483
129	NC_017633	CAT	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610484
130	NC_017633	GGC	2	6	6570	6575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387610484
131	NC_017633	GCC	2	6	6760	6765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387610484
132	NC_017633	GTT	2	6	6814	6819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387610484
133	NC_017633	AGA	2	6	6831	6836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387610484
134	NC_017633	ATC	2	6	7058	7063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610484
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153	NC_017633	CGCAG	2	10	8360	8369	20 %	0 %	40 %	40 %	387610485
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155	NC_017633	CAG	2	6	8418	8423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387610485
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159	NC_017633	TGC	2	6	8660	8665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610485
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